口袋奇兵中挑战高级副本的最优兵种是海军，其次为陆军，空军因培养成本高仅适合特定场景补充使用。
海军凭借低资源消耗、高成长性与克制主流陆军的属性优势，成为高级副本的首选。高级副本中敌方多以陆军防守为主，海军的克制关系可稳定打出高额伤害。阵容以贝塞尔、914、柏洛兹为核心，贝塞尔提供建筑增伤与点燃效果，914强化对陆军的爆发，柏洛兹保障续航。士兵搭配驱逐舰、航母与潜艇，形成控场、AOE与偷袭的组合，适配副本复杂地形与多波次敌人。配件优先强化护盾、导弹与伤害加深，进一步提升生存与输出能力。
陆军是稳定通关的备选，适合偏好稳健打法的玩家。陆军英雄体系成熟，喀秋莎搭配布莱德雷可实现高爆发与吸血护盾的联动，达成无损推图效果。面对高级副本的密集小怪与精英单位，喀秋莎的AOE技能可快速清场，布莱德雷提供减伤与续航，维利尔斯补充群体治疗，形成攻防一体阵容。士兵以坦克抗伤、火箭兵输出、工程兵修复，适配陆地关卡的阵地战需求。但陆军易被海军克制，需避开敌方海军为主的副本关卡。
空军不适合作为主力挑战高级副本，仅可辅助搭配。空军培养成本极高，英雄获取渠道有限，需投入大量资源才能成型。虽克制海军，但高级副本中海军敌人占比低，难以发挥优势。仅在特定水域关卡，可少量搭配马克西莫、丹特等空军英雄，利用免伤与爆发能力补充伤害，不可作为核心战力。
高级副本挑战需注重兵种克制与细节把控。战斗前分析敌方阵容，敌方陆军多则主力上海军，空军多则换陆军，避免被克制。英雄培养优先升五星解锁天赋，橙色碎片留给核心英雄，避免资源浪费。士兵合成优先提升主兵种等级，解锁克制伤害加成特性，增强副本输出。合理运用军阵系统，打克制选狂鲨，同兵种选毒蝎，被克制选战鹰，最大化阵容战力。
