保护措施主要围绕资源采集、舰队防御、基地布局和战术策略展开。首先需要确保工程船安全采集资源，建议将矿点选在基地附近或同盟控制区，避免单独深入危险区域。小型工程船可搭配721载货型提升仓储效率，中型工程车建议携带货拉拉增加容量，但注意不要过度编组以免效率递减。资源点采集时尽量让矿物位于计划圈边缘，方便采矿船使用曲速引擎缩短往返时间。矿区封锁功能需谨慎使用，前期性价比不高，除非遇到高价值矿区才值得消耗40策略值封锁。
航母和主力舰队的保护需要多管齐下。优先升级CV3000的血量闪避拦截系统，太阳鲸和南十字星则重点强化护甲属性。主舰队编组时建议搭配战巡抗伤，比如059或风暴级，战巡损失过半时及时撤退避免航母暴露。防空方面推荐配置光锥拦截机防止敌方重卡列维侧袭，基地主舰队需保持常备编队状态防止航母被分散。劣势局面下可将航母单独编队曲速撤离至小行星带等隐蔽区域，若基地被持续攻击且护盾失效，果断熔解航母保留资源重建更划算。
基地防护需要结合建筑升级与战术部署。新手保护期结束后，前哨指挥中心要优先建设并连接高等级矿点提升资源产量。采矿平台能节省计划圈并提供10%-30%采集加成，但需注意仅限同盟成员共享。基地迁移时选择金属和水晶资源丰富的区域，建议4金属3水晶2重氢的组合比例满足发展需求。日常保持工程舰与仓库舰混编减少往返耗时，战时开启自动维修功能避免舰队残血作战。若遭遇强敌围攻，可利用前哨站作为诱饵拖延时间，主力舰队迂回包抄或转移至安全区。
战术层面要善用计划圈和曲率航行机制。计划圈内已有我方舰队时可激活曲率航行，高速侦查舰先行探路后主力再增援能大幅缩短行军时间。封锁功能既可防御矿区也能用于刷野怪经验，3级封锁出8级野怪，4级出9级野怪，但要注意血量监控。交战时将敌方舰队引至盟友建筑附近形成夹击，避免单舰队突进。平时多完成运输和资源置换任务积累策略值，战斗指令默认沿用上次设置，记得取消自动撤回避免误操作。与3-5名玩家共享矿区能更有效应对资源争夺，同盟战争期间则需统一调度防御力量。
工程船研究优先点采集加速和仓库强化，技术值富余再提升移动速度。野怪清理时可用垃圾船吸引7级野怪增援部队分离敌人，主力集中消灭落单目标。中立1级黄色据点适合刷经验，每次55万经验且击败舰队后会自动恢复。舰队出发时预制模块无法用于战后维修，必须返回基地船坞处理。撤退路线建议用两个工程局加速回城，防止被追踪基地坐标。定期检查战报关注工程船状态，新手阶段尤其要利用好48小时保护期规划发展路线。
